航天飛控系統的安全與質量要求嚴格，大多數都按照航天A級和B級軟件進行開發、測試與控制。神舟IDE在開發的時候本身就是嚴格按照航天A級軟件進行開發，可以實現全軟件生命周期的與型號開展合作與工作。包括源碼以及相關設計與管理文檔的共享。

    同時針對當前國產化的要求，從技術層面上可以實現核心技術共享（包括天上操作系統的開發、調試和分析功能等），針對國產化國產中的特色、缺陷進行定制開發與測試驗證。從合作模式上也多樣化，可以按照OEM或者服務的形式開展工作。

    針對天上設備的特殊性，神舟軟件和北京微電子技術研究所等國內硬件廠商開展了戰略合作，可以全面負責底層硬件與上層型號業務軟件的接口（包括驅動、初始化、bootloader、燒寫等），讓型號單位從底層接口解脫出來，投入更多的資源與注意力到實際核心算法以及業務中，根本上的提高型號的開發效率并保證質量。

    神舟軟件從載人航天工程開始，就具備豐富的航天地面常用芯片的開發與合作經驗，包括部分芯片的開發與調試經驗，現在也和龍芯進行戰略合作，開展龍芯1/2/3系列的全面支持。針對地面的合作方式采用基于神舟IDE經過安全驗證并成功應用的編譯器的通用內核進行繼承，然后針對型號未來地面即將使用的芯片進行機器模塊的移植與驗證工作，這樣能做到快速支持未來型號所有硬件平臺，并最小范圍的影響已有編譯器，減少測試驗證與維護的成本。